公司以缺勤辞退员工的处理结果可能受以下特殊情况影响：
1. 公司规章制度不合法：若公司的缺勤处罚制度未经过民主程序制定或未向员工公示，即使员工存在缺勤行为，公司的辞退决定也可能被认定为违法。例如，公司以“缺勤1天即辞退”为由解雇员工，但该制度未公示，员工可主张辞退违法。
2. 员工缺勤有正当理由：若员工缺勤是因突发疾病、紧急事务等合理原因，且已按公司规定履行请假手续，公司以缺勤为由辞退可能不合法。例如，员工因家人突发疾病请假未获批准而缺勤，公司以此辞退员工，可能构成违法解除。
3. 公司未履行法定程序：若公司辞退员工前未通知工会或未听取员工申辩，可能因程序违法导致辞退无效。例如，公司直接向员工发出辞退通知，未提前通知工会，员工可主张辞退程序违法。
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公司以缺勤辞退员工可能存在以下法律风险，需引起重视：
1. 诉讼时效风险：劳动争议申请仲裁的时效为1年，若员工未在规定时间内维权，可能丧失胜诉权。例如，员工被辞退后6个月未采取任何维权行动，1年后再申请仲裁，仲裁机构可能以超过时效为由驳回申请。
2. 证据链断裂风险：若员工无法提供劳动合同、考勤记录等证据，可能无法证明劳动关系或公司辞退行为违法。例如，员工仅口头主张公司违法辞退，但无书面辞退通知，仲裁机构难以支持其诉求。
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针对公司以缺勤辞退员工的直接回复，可依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定进行法律分析：
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同且无需支付经济补偿。若公司能证明员工缺勤行为符合“严重违反规章制度”的情形（如规章制度明确缺勤天数标准且已公示），则辞退合法。若公司无法证明规章制度的合法性或员工缺勤未达严重程度，则构成违法解除。依据第四十七条，经济补偿按工作年限计算（每满一年支付一个月工资）；第八十七条规定，违法解除需支付赔偿金（经济补偿的2倍）。因此，若公司违法以缺勤辞退员工，员工有权主张赔偿金。
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关于公司以缺勤辞退员工的问题，员工的权益保障需结合辞退的合法性判断。以下为不同情形下的具体分析：
公司以缺勤辞退员工时，员工可能获得经济补偿或赔偿金，也可能无法获得补偿，需根据辞退是否合法确定。
1. 若公司以缺勤辞退员工的行为合法（如员工严重违反公司规章制度）：公司无需支付经济补偿或赔偿金，劳动关系依法解除。
2. 若公司以缺勤辞退员工的行为违法（如公司无合法有效的缺勤处罚制度、员工缺勤有正当理由等）：员工可要求公司支付赔偿金（标准为经济补偿的2倍）。
3. 若员工与公司协商一致解除劳动关系：公司需按员工工作年限支付经济补偿。

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